פרופ' אמנון בן תור לימד כחבר סגל של החוג (לאחר מכן מכון) לארכיאולוגיה באוניברסיטה העברית. בשנים 1974-7 כיהן כראש החוג ובשנים 1992-6 כראש המכון לאריכאולוגיה. בשנת 1988 נתמנה לבעל הקתדרה לארכאולוגיה של א"י על שם יגאל ידין. בשנת 1999 קיבל תואר דוקטור לשם כבוד מאוניברסיטת קומפלוטנסה בספרד, ובשנת 2000 קיבל את פרס שימל המוענק על ידי מוזיאון ישראל.
במרוצת השנים עסק בהוראה ומחקר באוניברסיטאות בחו"ל ביניהן הרווארד, ייל, פנסילבניה, קולומביה קמברידג' (אנגליה) והסורבון (פריז).
בין התלמידים לתואר שלישי אותם הדריך נמנים: רפאל גרינברג, דורון בן-עמי, שרון צוקרמן (ז"ל) ויוסף גרפינקל.
תחומי מחקר והוראה:
- הקשרים הבינלאומיים במזה"ק באלף הרביעי והשלישי לפנה"ס.
- אמנות הגליפטיקה בלבנט באלף הרביעי והשלישי לפנה"ס.
- הכרונולוגיה של המחצית הראשונה של האלף השני לפנה"ס.
- ארכאולוגיה – היסטוריה – מקרא.
- חצור של תקופות הברונזה והברזל.
חפירות:
חורבת עוצה (1963); ירמות (1970); אזור (1971); אתיינו, קפריסין [בשיתוף עם ט. דותן]
(1971-2); תל קירי (1975-6); יקנעם (1977-9, 1981, 1987-8); תל קשיש (1978-9, 1981-5; 1987); חצור (1990 - 2018).
בשנים 1971-2 ניהל ביחד עם הפרופ. טרודה דותן את החפירות באתר אתיינו שבקפריסין – החפירה היחידה עד כה של אוניברסיטה העברית בחוץ לארץ.
פירסומים נבחרים (החל משנת 2000):
ספרים:
1) Tel Qashish, Final Report (Qedem Reports No. 5, The Institute of Archaeology, The Hebrew University), Jerusalem: Institute of Archaeology, Hebrew University of Jerusalem, 2003 (co-authors: R. Bonfil and S. Zuckerman).
2) Yoqne'am vol. II, The Iron Age (Qedem Reports No. 6, The Institute of Archaeology, The Hebrew University), Jerusalem: Institute of Archaeology, Hebrew University of Jerusalem, 2005, (co-authors: A. Zarzecki-Peleg and S. Cohen-Anidjar).
3) Yoqne'am vol. III, The Middle and Late Bronze Ages (Qedem Reports No.7, The Institute of Archaeology, The Hebrew University), Jerusalem: Institute of Archaeology, Hebrew University of Jerusalem, 2005 (co-authors: D. Ben-Ami and A. Livneh).
4) Back to Masada, Jerusalem: Yad Izhak Ben-Zvi, 2009.
נוסח בעברית :בחזרה למצדה, ירושלים: יד יצחק בן-צבי, 2009.
5) Hazor vol. VI –The Iron Age, Final Report (Seasons of 1990 – 2006 of the renewed excavations), Jerusalem: Israel Exploration Society; Institute of Archaeology, the Hebrew University of Jerusalem, 2012 (co-authors: D. Ben-Ami and D. Sandhaus).
6) Hazor, Canaanite Metropolis and Israelite Town, Jerusalem: Israel Exploration Society ; Biblical Archaeology Society, 2016.
נוסח בעברית: חצור, מטרופולין כנענית ועיר ישראלית, ירושלים: החברה לחקירת ארץ ישראל ועתיקותיה, 2015.
מאמרים:
1) Hazor and the Chronology of Northern Israel: A reply to Israel Finkelstein, BASOR 317 (2000): 9-13
2) The Fall of Canaanite Hazor, Monografies Eridu I, Barcelona 2001: 227-231.
3) ארכיאולוגיה – מקרא – היסטוריה, בתוך: ל' לוין וע' מזר (עורכים), הפולמוס על האמת ההיסטורית במקרא, ירושלים תשס"א, 25-17.
4) Hazor – A City State between the Major Powers, A Rejoinder, SJOT 16 2002: 301-308.
5) כנען הישנה וישראל החדשה, ארץ ישראל כז (ספר חיים ומרים תדמור), ירושלים תשס"ג, 54-50.
6) Hazor and Chronology, Ägypten und Levante XIV (2004), 45-67.
7) Ceremonial Palace, Not a Temple, BAR 32/5 2006: 8, 78-79
8) Do the Execration Texts Reflect an Accurate Picture of the Contemporary Settlement Map of Palestine? in Y. Amit et al. (eds.), Essays on Ancient Israel in Its Near Eastern Context, A Tribute to Nadav Na'aman, Winona Lake 2006, 63-87.
9) The Sad Fate of Statues and the Mutilated Statues of Hazor, in S. Gitin, J.E. Wright and J.P. Dessel (eds.), Confronting the Past, Archaeological and Historical Essays on Ancient Israel in Honor of William G. Dever, Winona Lake 2006, 3-16.
10) The 'White Building' Is a Temple: Response to Bonfil and Zarzecki-Peleg, IEJ 58 (2008): 94-99.
11) Hazor at the End of the Late Bronze Age: Back to Basics, BASOR 350 (2008): 1-6 (co-author - S. Zuckerman).
12) Hazor, in E. Stern, (ed.), The New Encyclopedia of Archaeological Excavations in the Holy Land, vol. 5, Jerusalem 2008, 1769-1776.
13) A Decorated Jewellery Box from Hazor, Tel-Aviv 36 (2009): 5-67.
14) חידה ארכאולוגית בתל חצור, ארץ ישראל כט (ספר אפרים שטרן), ירושלים תשס"ט, 74-50 (בהשתתפות ד' ציגלר וו' אברוטיס).
15) המתחם הפולחני בעיר העליונה של חצור, קדמוניות 45 (2012) 9-3.
16) Who Destroyed Canaanite Hazor, BAR 39/4 (2013): 27-36.
17) The Ceremonial Precinct in the Upper City of Hazor, Near Eastern Archaeology 76/2 (2013): 81-89.
18) Hazor in the Tenth Century B.C.E., Near Eastern Archaeology 76/2 (2013): 105-109.
19) A Decorated Box in the Collections of the Bible Lands Museum, Jerusalem, Egypt and the Levant XXII/XXIII (2012-2013): 317-338.
20) Iron Age IIA-B: Northern Valleys and Upper Galilee, in S. Gitin (ed.) The Ancient Pottery of Israel and its Neighbors from the Iron Age through the Hellenistic Period, Vol. 1, Jerusalem 2015, 135-188 (co-author: A. Zarzecki-Peleg).
21) Hazor, in Encyclopedia of the Bible and Its Reception, Vol. 11, Berlin 2015, 440-44.
22) A Fourth-Millennium BCE Seal from Hazor, in S. Ganor et al., (eds.), From Sha’ar Hagolan to Shaaraim, Essays in Honor of Prof. Yoseph Garfinkel, Jerusalem 2016, 187-203.
23) Qui a Détruit la Cité Biblique de Hatsor, Pour La Science (466), Paris 2016, 52-61.
24) A Cooking-Pot from Hazor with Neo-Hittite (Luwian) Seal Impressions, in O. Lipschits, Y. Gadot and M.J. Adams (eds.), Rethinking Israel. Studies in the History and Archaeology of Ancient Israel in Honor of Israel Finkelstein, Winona Lake 2017, 29-45 (co-authors: A. Cohen Weinberger and M. Weeden).