מחקר

במכון לארכאולוגיה פועלות מספר יחידות מחקריות בתחומי שונים ומגוונים:

תחומי המחקר של המכון מתחלקים למדורי המכון אשר מחולקים לפי תקופות כרונולוגיות

מעבדות - המעבדה לארכאוזואולוגיה (בקמפוס גבעת רם), המעבדה לארכאולוגיה חישובית, המעבדה לחקר חומרים ארכיאולוגיים וטכנולוגיות קדומות, המעבדה לארכיאולוגיה מרחבית והמעבדה לשימור. 

כמו כן פועלות יחידות נוספות העוסקות בתיעוד גרפי ומרחב העוסק בארכיאולוגיה ניסויית.